PhD student mycetoma drug target discovery
Key Skills
Job Description
Job Description Eumycetoma is a tropical neglected infectious disease characterised by massive tumourlike lesions on the foot. In may 2016 it was recognized by the WHO as a neglected tropical disease. Within these lesions the fungal causative agent will form grains which act as a shield for antimicrobial agents. This makes the disease difficult to treat, with a poor therapeutic outcome and 25% of the patients undergoing amputation. In order to improve the treatment of mycetoma, we need to identify novel drug targets. In this project we are therefore looking for an enthusiastic PhD candidate who use a combination of transcriptomic and proteomic approaches to identify fungal genes and proteins involved in mycetoma development. To determine which of these genes are essential for mycetoma development knock-outs will be created. This project is part of a large international consortium and international exchange visits can be part of the project. During your PhD trajectory you will combine computional analysis and wet-lab experiments. You will be supervised by a supervisor and co-supervisor and have weekly meetings to monitor your progress. You will have the opportunity to present your results internationally within the consortium as well as during international conferences.
Core Responsibilities
Use transcriptomic and proteomic approaches to identify fungal genes and proteins involved in mycetoma development. Create gene knockouts to determine which targets are essential for disease development, combining computational analysis with laboratory experiments.
Requirements
The posting seeks an enthusiastic PhD candidate to conduct research combining computational analysis and wet-lab experiments. No specific prior experience, degree, or other formal qualifications are stated.
About Erasmus MC-Klinische Chemie
Industry: Research Services
Company size: 51-200 employees
Onze afdeling Klinische chemie wil vanuit haar kennis en proces-georiënteerde werkwijze leidend zijn binnen het vakgebied Personalized Medicine / Laboratory Medicine en deze kennis overdragen aan de medisch specialisten van nu en de toekomst. 𝗪𝗮𝘁 𝘄𝗶𝗹𝗹𝗲𝗻 𝘄𝗶𝗷: De afdeling klinische chemie wil haar pijlers op de technologische (Omics) ontwikkelingen richten, bv. metabolomics en farmacogenomics, waarbij de integrale, big data aanpak, steeds belangrijker wordt. De afdeling Klinische Chemie wil naast evaluatie van analytische en klinische performance van testen, ook informatie over klinische effectiviteit van (nieuwe) diagnostische testen genereren bij de translatie van beloftevolle biomarkers tot medische testen. De afdeling Klinische Chemie wil een belangrijke bijdrage hebben in de overdracht van haar kennis en kunde aan nieuwe generaties artsen, specialisten laboratoriumgeneeskunde, laboratoriummedewerkers en andere professionals in de zorg, en daarmee naar uitdaging en voldoening van haar medewerkers. 𝗪𝗮𝘁 𝗯𝗲𝗼𝗴𝗲𝗻 𝘄𝗲 𝗺𝗲𝘁 𝗼𝗻𝘇𝗲 𝗽𝗿𝗼𝗰𝗲𝘀-𝗴𝗲𝗼𝗿𝗶ë𝗻𝘁𝗲𝗲𝗿𝗱𝗲 𝘄𝗲𝗿𝗸𝘄𝗶𝗷𝘇𝗲? Voor goede en snelle diagnostiek is procesoptimalisatie van groot belang. Door het gebruik 1 laboratorium informatiesysteem in het Erasmus MC is het sinds kort mogelijk om de lichaamsmateriaal waarvan diagnostiek is aangevraagd, real-time te volgen. Dat wil zeggen: iedere stap wordt vastgelegd en de efficiëntie van het gehele proces kan geanalyseerd worden. Op deze wijze kan de afdeling Klinische Chemie steeds slimmer omgaan met data die voortkomen uit het gehele proces van de individuele aanvragen. Met die kennis kunnen geleidelijk alle processen binnen de laboratoriumdiagnostiek, inclusief de DNA diagnostiek, geoptimaliseerd worden. Alles in het belang van de patiënt.